36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0070 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  91.04 
 
 
85 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  90.14 
 
 
85 bp  85.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  90.77 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  97.56 
 
 
83 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  97.37 
 
 
83 bp  67.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  87.69 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  87.69 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  91.07 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 
88 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  96.55 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  96.15 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>