119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0003 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  86.52 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  84.27 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4277  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3989  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00811518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0048  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.326057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4236  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.770819999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2057  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000000934529  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0074  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0049  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07681  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00058  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t72  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0449352  hitchhiker  0.00732029 
 
 
-
 
NC_002950  PGt50  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.916446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0018  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t57  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA64  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R18  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104316  normal  0.0469264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0108  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425396  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0095  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0044  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4701  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000616666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0141  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1413  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.192741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0097  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3470  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00513731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0004  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0990268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0135  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.512997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3660  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0342114  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3551  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3587  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.453688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3481  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3481  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241057  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3649  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4496  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00806213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0008  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0071  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0078  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3261  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3263  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.798802  normal  0.436937 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>