53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0047 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  89.55 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0021  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000367535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 81 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.249535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0544  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4277  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0051  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00811518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3989  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1619  tRNA-Leu  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0724475  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.44875e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000720687 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>