22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_R0034 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  93.9 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  99.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 81 bp  60  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0046  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>