180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_tRNALeuVIMSS1309291 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  96.34 
 
 		 82 bp  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  96.34 
 
 		 82 bp  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  93.9 
 
 		 82 bp  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  91.46 
 
 		 1389 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 82 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  91.46 
 
 		 81 bp  99.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  99.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  89.02 
 
 		 82 bp  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 81 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  100 
 
 		 1356 bp  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0052  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  87.01 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 83 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00313005  normal  0.455942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0021  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000367535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60230  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.806101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t093  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553004  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000786823  normal  0.701139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t72  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0449352  hitchhiker  0.00732029 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t092  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t57  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA64  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R18  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104316  normal  0.0469264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0160  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0258592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0109  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0125  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104989  normal  0.132999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0125  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000725635  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  83.13 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0114  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000507523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0115  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0116  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000605534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0040  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0990268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0095  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  100 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>