60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0040 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0046  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00313005  normal  0.455942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0068  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000622539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t72  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0449352  hitchhiker  0.00732029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0877  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00381857  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0095  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0097  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0004  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0990268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1202  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1733  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t57  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA64  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R18  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104316  normal  0.0469264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0024  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.622642  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0160  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0258592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna149  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60230  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>