84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t1877 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  127  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  91.94 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 91 bp  69.9  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 89 bp  67.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1772  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0851  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0074  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0040  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>