64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t0851 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_t0851  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  88.75 
 
 
84 bp  87.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  88.73 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0029  tRNA-Leu  86.57 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  94.87 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  94.87 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  97.06 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  89.13 
 
 
87 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  86.79 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  89.74 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  91.43 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0160  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0258592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>