129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0067 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0851  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0002  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.164011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0035  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>