148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5685 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  89.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  88.1 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  88.1 
 
 
84 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0010  tRNA-Leu  95.83 
 
 
87 bp  79.8  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000185215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  86.9 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  87.84 
 
 
84 bp  69.9  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  97.37 
 
 
83 bp  67.9  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  95.24 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  95.12 
 
 
83 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu04  tRNA-Leu  88.33 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000617497 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  92.68 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  92.68 
 
 
84 bp  58  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0042  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  96.97 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0057  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0082  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212211  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0020    90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00753616  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0008  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.659495  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0010  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0007  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.606248  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0058  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  94.29 
 
 
84 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0050  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA50  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.391222  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0009  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0052  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 
83 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0055  tRNA-Leu  91.89 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.472403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  90.24 
 
 
90 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 
89 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  93.94 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0091  tRNA-Leu  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  96.43 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0006  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.806028  normal  0.553629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  96.3 
 
 
91 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.916956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  91.43 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.660647 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>