128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-8 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  127  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  97.92 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  95.83 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0023  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.964381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0089  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000216717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0020  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.913906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0075  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0074  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0068  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.944852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0076  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0067  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0010  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000415832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0069  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0087  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>