148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0002 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 87 bp  99.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  91.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0026  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0068  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00533985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1246  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.157019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0044  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.784773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  83.72 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0052  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129877  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0851  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>