141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0032 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  97.83 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  91.8 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  97.67 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0047  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  84.71 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt51  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_003295  RS02877  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000533754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03726  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0825956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60600  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65220  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0021  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  82.14 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0077  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.941886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0078  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.914588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0048  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.547841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0059  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0017  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0064  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>