More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0037 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  95 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0070  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0066  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0016  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.672114  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0903  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60600  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60590  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65210  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65220  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0057  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0333458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>