More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0057 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  95.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  91.55 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0064  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0026  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0068  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  83.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  95.92 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  86.05 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0049  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5665  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0095  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000279268  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0841  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0034  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.956529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0036  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777471  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0054  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0044  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0171508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1764  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000024558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4201  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.21132e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4272  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5666  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1772  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0527  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000711336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4274  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4273  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.901226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1768  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>