87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t2563 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0731155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0088  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0092  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0614  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000183517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5720  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.285186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0139489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5685  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0253862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4763  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000114047  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0539  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.1762e-32 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0116121 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0071  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.584885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0046  tRNA-Leu  87.72 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0032  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0052  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4578  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0102  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0002  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0038  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248476 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00250  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0039  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.53557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257366  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>