52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflt08 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0487  tRNA-Leu  94.2 
 
 
85 bp  105  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0373376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  97.22 
 
 
84 bp  63.9  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1381  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 
90 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.44 
 
 
87 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2563  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0033  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000656605  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  91.67 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  91.67 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  96.3 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  96.3 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0025  tRNA-Leu  89.74 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00953223  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.18 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  91.18 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  91.18 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.18 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  91.18 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  93.33 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>