49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0487 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0487  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0373376  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  94.2 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0661165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1381  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0027  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130394  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0039  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20505  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0071  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.914369  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0094  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1826  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0770731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0342  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000180418  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0923  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.536806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>