42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1381 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1381  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt08  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00502117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0020  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.435653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0487  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0373376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0068  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0020  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0034  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000115228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>