165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03930 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 84 bp  97.6  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0007  tRNA-Leu  86.42 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.90958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309296  tRNA-Leu  85 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309380  tRNA-Leu  85 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  83.95 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0069  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00338367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0079  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0019  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0021  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0031  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0058  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000059003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0103  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.937736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0027  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0171  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.661922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0030  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.931427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  84.06 
 
 		 1263 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0049  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.16871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>