17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t1465 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  88.33 
 
 
87 bp  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  88.33 
 
 
87 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0050  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0041  tRNA-Leu  90 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1454  tRNA-Leu  91.43 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0851  tRNA-Leu  91.43 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0067  tRNA-Leu  91.18 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000720864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  96.15 
 
 
80 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>