38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0026 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  167  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  96.15 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0060  tRNA-Leu  100 
 
 
92 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.118577 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>