More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0006 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0075  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000415832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4807  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000360062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4968  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000650666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0023  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0089  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000216717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4910  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00037453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4806  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000584186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4969  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000625029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5114  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4875  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000898834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00811405  normal  0.0178437 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>