93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0005 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0027  tRNA-Leu  87.21 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000345665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0077  tRNA-Leu  95 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0047  tRNA-Leu  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00091084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0024  tRNA-Leu  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000298281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0026  tRNA-Leu  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0679  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2790  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000401538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2793  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000950853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2796  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000297688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0677  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2476  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00963424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2479  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100128  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2482  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0075  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000629352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000637838  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0011  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0013  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000293316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0057  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0013  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0057  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.583439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0022  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0036  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0178  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0596776  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0029  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00602273  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2169  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00848562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0015  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0020  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.020101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0045  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  normal  0.134818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0034  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00470609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1577  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1612  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.707848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000907276  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0018  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000485581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0742482  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0237  tRNA-Leu  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000149567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0008  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0032  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000109128  hitchhiker  0.00302249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu01  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0005  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.570293  normal  0.011385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>