74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1519 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  95.83 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0002  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.164011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 89 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R11  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>