29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0054 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309259  tRNA-Leu  84.88 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  84.81 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0911  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0029  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000953822  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>