228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0003 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0016  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127498 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0002  tRNA-Leu  95.06 
 
 		 87 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0031  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000068537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0030  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000421149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t101  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000108227  normal  0.0525224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0038  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000116483  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0037  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000758461  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t102  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000565255  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0019  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000052132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0020  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000559714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0018  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000477494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0019  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000288253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0109  tRNA-Leu  92 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000331868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0049  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0064  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0026  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0068  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000599691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0063  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97423e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0062  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0003  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.399335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0086  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.378994  normal  0.691474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0116  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000605534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t72  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0449352  hitchhiker  0.00732029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t57  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  92.11 
 
 		 98 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0004  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0990268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA64  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R18  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104316  normal  0.0469264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0040  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0095  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0097  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0043  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000564776  hitchhiker  0.00000000298253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  85.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 82 bp  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  83.12 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t092  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t093  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0125  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104989  normal  0.132999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0126  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553004  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0125  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000725635  normal  0.695646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0126  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000786823  normal  0.701139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0115  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>