189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0026 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0026  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000599691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0026  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.44875e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.806101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0032  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00179393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0018  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0025  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579684  normal  0.318502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0032  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0024  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.622642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0004  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0877  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00381857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0041  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1202  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5141  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1733  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0013  tRNA-Leu  95 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0024  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000365355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0034  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0023  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0839  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0738  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0135197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1289  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1149  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1298  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0033  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735021  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0000968833  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2227  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2149  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0008  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1282  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0013  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.97423e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>