287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_R0002 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  98.78 
 
 
1389 bp  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  98.78 
 
 
82 bp  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  98.78 
 
 
82 bp  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309361  tRNA-Leu  93.9 
 
 
82 bp  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0029  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309185  tRNA-Leu  91.46 
 
 
82 bp  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0718906  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  99.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  89.02 
 
 
85 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  89.02 
 
 
82 bp  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0001  tRNA-Leu  87.8 
 
 
81 bp  75.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  86.59 
 
 
82 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0003  tRNA-Leu  87.8 
 
 
81 bp  75.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0687845  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0037  tRNA-Leu  87.8 
 
 
81 bp  75.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  94.87 
 
 
1356 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  92.31 
 
 
84 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
2679 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  96.55 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  96.55 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0836194  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309345  tRNA-Leu  96.55 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.419344  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  96.55 
 
 
84 bp  50.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  96.55 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  96.43 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0004  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0173175  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000105173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  90 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309087  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309138  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  96.43 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309179  tRNA-Leu  96.43 
 
 
82 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0032    100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.333089  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.279454  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888943  normal  0.34403 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>