37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0046 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0046  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0003  tRNA-Leu  95.6 
 
 
91 bp  143  8e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  89.19 
 
 
87 bp  79.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  87.84 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0160  tRNA-Leu  87.5 
 
 
88 bp  71.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0258592  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.56 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  86.49 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  85.14 
 
 
87 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  96.77 
 
 
82 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  96.77 
 
 
82 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  96.77 
 
 
87 bp  54  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  96.67 
 
 
87 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0028  tRNA-Leu  92.68 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.249535  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0026  tRNA-Leu  92.68 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000397125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0009  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  96.55 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0002  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.164011  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0035  tRNA-Leu  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 
81 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  96.43 
 
 
81 bp  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  89.36 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>