138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0002 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0051  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0010  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000723961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0032  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00179393  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0018  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0032  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0025  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579684  normal  0.318502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1282  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0256  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2149  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2227  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0033  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735021  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0026  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.44875e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0077  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1614  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0047  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137479 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0544  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1619  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0724475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0023  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0074  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0038  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0024  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000365355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0005  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0007  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0043  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0080  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>