183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t14 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t14  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000206459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0017  tRNA-Leu  98.78 
 
 		 82 bp  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000127557  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0022  tRNA-Leu  98.78 
 
 		 82 bp  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.0213265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0010  tRNA-Leu  98.78 
 
 		 82 bp  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000723961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0029  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 82 bp  147  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0125936  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0038  tRNA-Leu  92.42 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1614  tRNA-Leu  95.83 
 
 		 85 bp  79.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0020  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0024  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000365355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0080  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0005  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0007  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0043  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0738  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0135197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1289  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1298  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0023  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0030  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0008  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.577966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0034  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0032  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  93.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0041  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135898  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0839  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1149  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0022  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0074  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0018  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0032  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00179393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0032  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.979031  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0025  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.579684  normal  0.318502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2149  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2227  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0077  tRNA-Leu  97.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0019  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0044  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000717769  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0041  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0036  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0011  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0552759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1282  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0033  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735021  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0057  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000344559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0026  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000721197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0037  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.5451e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0056  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000684765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0034  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0013  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0035  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.661326  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0043  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.446566  hitchhiker  0.00000163601 
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2631  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>