180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0256 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0256  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  176  6e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  89.55 
 
 
87 bp  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  88.24 
 
 
98 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  88.24 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  88.24 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  88.24 
 
 
87 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  88.06 
 
 
87 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  88.06 
 
 
87 bp  69.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  86.76 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  86.76 
 
 
87 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0047  tRNA-Leu  89.55 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.398541  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0035  tRNA-Leu  93.02 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.671862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0017  tRNA-Leu  93.02 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  92.86 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  92.86 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu04  tRNA-Leu  92.86 
 
 
89 bp  60  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.353437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  92.86 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  88.89 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  86.36 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0047  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0016  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0099  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.116508  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0033  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735021  normal  0.235069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  92.68 
 
 
85 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0051  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0107  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  58  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.57373  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  85.29 
 
 
87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0028  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.179122  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0012  tRNA-Leu  85.29 
 
 
87 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.898265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0122  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000181545  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0123  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000143364  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  85.29 
 
 
87 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0140  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180283  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0019  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.369555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  54  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0074  tRNA-Leu  90.7 
 
 
84 bp  54  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0013  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0072  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0041  tRNA-Leu  90.7 
 
 
85 bp  54  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135898  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1282  tRNA-Leu  92.31 
 
 
86 bp  54  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.585329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0018  tRNA-Leu  94.29 
 
 
87 bp  54  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  94.87 
 
 
87 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0026  tRNA-Leu  87.27 
 
 
87 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000599691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2149  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2227  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  54  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60360  tRNA-Leu  90.48 
 
 
83 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62800  tRNA-Leu  90.48 
 
 
83 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0065  tRNA-Leu  90.48 
 
 
86 bp  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5466  tRNA-Leu  90.48 
 
 
88 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.138574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0010  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0018  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000323651  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0080  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0012  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  90.24 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0076  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606872  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  90.24 
 
 
82 bp  50.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0013  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00398291  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3989  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460311  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3481  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3587  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.453688  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0005  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.13932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.17393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0007  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1129  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.157736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0043  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0469942  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0084  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0068  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478917  normal  0.0818589 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0080  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0068  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000344448  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0010  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000141712  hitchhiker  0.00444268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3660  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0342114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0062  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332284  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  86.79 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4277  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3551  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4701  tRNA-Leu  93.94 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000616666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5072  tRNA-Leu  93.94 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000520026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>