49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0056 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  89.41 
 
 		 83 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3379  hypothetical protein  90.38 
 
 		 174 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  82.35 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>