159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_R0105 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0032    92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.333089  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0031  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0047  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.279454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0052  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888943  normal  0.34403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t19  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t20  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178087  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4338  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0010  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0030  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0052  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0014  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0110996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0034  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.566958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0645  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.282647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0013  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0009  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553252  normal  0.0230597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA39  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220768 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1044  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255738  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0019  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0000161496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.419334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0037  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477957  normal  0.0356548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4568  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.666254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0030  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.299812  normal  0.066505 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6043  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.843688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0047  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.899585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0044  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0036  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247967  decreased coverage  0.00943738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0044  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0004  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0029  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000126446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t72  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0449352  hitchhiker  0.00732029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t57  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA64  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0004  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0990268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R18  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104316  normal  0.0469264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0056  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0095  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.281966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0097  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0052  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0030  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0082  tRNA-Leu  83.56 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000269162  normal  0.128864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0025  tRNA-Leu  83.56 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116004  normal  0.383928 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0029  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1413  tRNA-Leu  85 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.192741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0037  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0634  tRNA-Leu  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.323401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0021  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763911  hitchhiker  0.00000000000407532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.425813  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0022  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.964381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0023  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  82.67 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1958  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.301935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1748  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>