149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0034 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.670287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0063  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.381313  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0005  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 89 bp  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu01  tRNA-Leu  88.76 
 
 		 92 bp  97.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  88.31 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0088  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0057  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000965884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0025  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0643  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0014  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000912382  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0011  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000652863  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0015  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0021  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0038  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0029  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000562682  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0041  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3125t  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.556265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03400  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06707  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_003295  RS04001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000386269  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t58  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.544778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t59  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.523446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA2  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA3  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R10  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.919208  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0037  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0307  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0033  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0028  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.385004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0047  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03461  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0132208  normal  0.375056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t019  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0731523  normal  0.959271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1434  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2360  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0006  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1060  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148501  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0011  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0552759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000982654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.243521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505134  normal  0.14321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519454  normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  normal  0.115675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000435375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0068  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000144281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0079  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000299649  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0076  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.445287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000103773  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000195889  normal  0.0261952 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0008  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0053  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1064  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1805  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0412  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.56087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0100  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000931181  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0104  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000390142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0124  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00204049  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0128  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>