20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_R0027 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 81 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00487683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0582  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  84.06 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0014  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>