25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_R0032 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.0561514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07980  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  83.87 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>