16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0031 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0027  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00487683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.399709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.23458  hitchhiker  0.000680793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.273052  hitchhiker  0.00863967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_R0081  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10010  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.592276  normal  0.477324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>