60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0069 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12940  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266411  normal  0.24384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0034  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0047  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0027  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0047  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000036656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0013  tRNA-Leu  87.76 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.111506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  88.64 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0134  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0099  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000225744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0023  tRNA-Leu  85.53 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  86.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5731  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0103  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000553911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0859  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5638  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.114187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5029  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5814  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0217  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000698181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4572  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000682737  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0784  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4998  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0017  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000565003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0032  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1225  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000848373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0040  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5693  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000772735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5727  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000902982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000281686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-7  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0100  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000205761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000754212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609501  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0038  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0023  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0238053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0138  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00946878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>