49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR_t18 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR_t18  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1015  tRNA-Leu  98.8 
 
 		 88 bp  157  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0038  tRNA-Leu  98.8 
 
 		 86 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.504374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0041  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA43  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815799  normal  0.0189224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t36  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0727385  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0022  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000237873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna29  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.181713  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0025  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0926964  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0025  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.262204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0005  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0043    94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.935745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0023  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0019  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4571  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0933967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0037  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0025  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19630  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93343  normal  0.0188921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309350  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.901814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03930  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.323801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0032  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102666  normal  0.269266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>