41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0433 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  97.62 
 
 
86 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  97.14 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  94.87 
 
 
83 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  95.35 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  87.88 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.86 
 
 
83 bp  60  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  94.44 
 
 
83 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0051  tRNA-Leu  94.74 
 
 
86 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.183194  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  94.12 
 
 
87 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0027  tRNA-Leu  91.89 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0582  tRNA-Leu  94.44 
 
 
89 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.604071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14940  tRNA-Leu  93.75 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.183557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  96.43 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  90 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0013  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0899953 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00568015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_712  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0740718  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  96.3 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201383  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0823  tRNA-Leu  96.3 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4326  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.92812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0060  tRNA-Leu  91.43 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000227715  normal  0.912821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0044  tRNA-Leu  96.3 
 
 
81 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.968871  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2245  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000124407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1032  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.56958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0184  tRNA-Leu  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1729  tRNA-Leu  96.3 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.716299  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0020  tRNA-Leu  93.55 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121967  normal  0.525064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  91.18 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1590  tRNA-Leu  92.11 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.154762  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  91.18 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  91.18 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  91.18 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  91.18 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>