202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0008 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  95.31 
 
 		 85 bp  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  91.25 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  88.75 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  93.22 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 82 bp  85.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0013  tRNA-Leu  86.25 
 
 		 82 bp  71.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0020  tRNA-Leu  87.32 
 
 		 82 bp  69.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  85 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  85 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0022  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0022  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0020  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24589  normal  0.0928681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4585  tRNA-Leu  88.14 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00013  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000122077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0062  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.8923600000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0027  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000908106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0762  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000162709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0063  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000661955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0105  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651737  normal  0.103844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0016  tRNA-Leu  87.93 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.718102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0034  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000358312  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0784  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000606436  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0723  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0075  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0062  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0030  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.249207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0034  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000338486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  83.75 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t015  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t010  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000827659  hitchhiker  0.00000000052642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  86.44 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0111  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000389505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0128  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0119  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0037  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.948936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0016  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.23668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>