68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0064 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  100 
 
 		 81 bp  54  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0003  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 84 bp  54  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00137564  hitchhiker  0.00000072706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0022  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210524  normal  0.0833879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1022  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0362135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0023  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00937245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0018  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0075  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000964905  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0077  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0015  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1815  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0144  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00805168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1748  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487544  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2520  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0024  tRNA-Leu  84.51 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0016  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.977915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0086  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0082  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00186312  normal  0.0281447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0033  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000096858  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0680936  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1969  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000129423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000003271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0039  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0545231  normal  0.269092 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0012  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>