35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0025 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  96.34 
 
 		 82 bp  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  96.34 
 
 		 85 bp  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  131  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t20  tRNA-Leu  93.9 
 
 		 85 bp  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.696228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  93.9 
 
 		 85 bp  123  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11040  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.12642  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0039  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.32934  normal  0.56241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0031  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.9705100000000005e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0038  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.03097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0032  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0060  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0064  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  84.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0013  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0049  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0029  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0026  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0068  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>