34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0025 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0033  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 85 bp  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0038  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.272303  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0012  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0002  tRNA-Leu  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0002  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0015  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0001  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0003  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0002  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0024  tRNA-Leu  89.19 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0021  tRNA-Leu  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.273814  normal  0.0446138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0060  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.475799  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0015  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0028  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0030  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0053  tRNA-Leu  86.3 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0067  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.394732  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0028  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0023  tRNA-Leu  84.72 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00546123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0044  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0048  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00301923  normal  0.303873 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0005  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.196459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0028  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000463035  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0004  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0554564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0059  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0003  tRNA-Leu  83.1 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00540287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0058  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0282229  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>