14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R12 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R12  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0036  tRNA-Leu  85 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0037  tRNA-Leu  85 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0030  tRNA-Leu  84.62 
 
 
82 bp  60  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0277712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  84.81 
 
 
83 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  84.62 
 
 
82 bp  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0039  tRNA-Leu  82.72 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  84.06 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  96.3 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  96.15 
 
 
83 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>