54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0029 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0029  tRNA-Leu  88.16 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000498774  normal  0.0770032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07180  tRNA-Leu  88.31 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000122258  normal  0.69512 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596952  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10180  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000392924  hitchhiker  0.000000470652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0011  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 84 bp  58  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00270882  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0625  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00420103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0003  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0150  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0032  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0127  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000102689  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0124  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141518  normal  0.195721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0122  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0120  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00172985  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0155  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000253856  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0055  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.796576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0035  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000172953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0025  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0093  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000286418  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0095  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337125  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0099  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000588757  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0128  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00106969  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0130  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584266  normal  0.382411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0133  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000286761  normal  0.279281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0148  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739603  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0152  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0158  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000965884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0021  tRNA-Leu  82.5 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07705  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.518259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0089  tRNA-Leu  85.14 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.846262  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>