42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0010 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.210908  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1466  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2214  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0764  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.509381  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2038  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000144559  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1759  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 82 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1681  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.602925  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 80 bp  50.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0034  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498684  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA33  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.962701 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0046  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309198  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.439755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0040  tRNA-Leu  82.86 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0858293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60230  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0057  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811413  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t43  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0642422  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0786  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.875757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0067  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50283  hitchhiker  0.00109765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0042  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0065  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.401468  normal  0.0428865 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0001  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.761083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t52  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329875  normal  0.0339044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>