22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_R0010 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.102208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0054  tRNA-Leu  98.82 
 
 		 85 bp  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.875757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0052  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0025  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0221479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581648  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0025  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000312585  hitchhiker  0.0000000105189 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1154  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0862  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0047  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>